提出了泛HLA-DR結合表位（PADRE-肽AKFVAAWTLKAAA）作為簡單的表位肽，其可用于合成和重組疫苗的開發。

T細胞表位通過MHC分子呈現在抗原呈遞細胞的表面上。這些T細胞表位通常是大小在8至11個氨基酸之間的肽，并顯示MHC特異性序列基序。這些抗原肽是通過蛋白水解細胞質中的非結構蛋白和結構蛋白而產生的。然后，肽-MHC-1復合物被抗原呈遞細胞轉運到細胞表面，并被CD8 +細胞毒性T淋巴細胞（CTL）識別。這種相互作用引起CTL的分化。激活的CTL裂解受感染的細胞，分泌細胞因子并繁殖。這種機制可確保識別出被病毒，細胞內細菌或腫瘤細胞感染的細胞，因為病原體或癌癥特異性的MHC肽復合物存在于細胞表面。CTL可以檢測并消除此類異常細胞。MHC-1和II分子的基因是多態的。每個MHC等位基因均具有不同的肽結合基序，可識別定義序列位置中的某些氨基酸錨殘基。