biochain K5011610說(shuō)明書(shū)
cfPure® Cell Free DNA Extraction Kit (100 ml)
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K5011610
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BioChain的cfPure®無(wú)細(xì)胞DNA提取試劑盒旨在快速有效地純化循環(huán)中的無(wú)細(xì)胞DNA（cfDNA）。該系統(tǒng)利用二氧化硅涂層的順磁性顆粒來(lái)凈化無(wú)細(xì)胞[…]
描述
BioChain的cfPure®無(wú)細(xì)胞DNA提取試劑盒旨在快速有效地純化循環(huán)中的無(wú)細(xì)胞DNA（cfDNA）。該系統(tǒng)利用涂有二氧化硅的順磁性顆粒來(lái)純化無(wú)細(xì)胞DNA，其血清或血漿的濃度從不到1 mL到大于10 mL。開(kāi)發(fā)緩沖液以確保有效回收100 bp – 500 bp DNA片段，以一定程度地回收無(wú)細(xì)胞DNA。回收的DNA適用于廣泛的下游應(yīng)用，例如亞硫酸氫鹽測(cè)序，NGS和qPCR。
從血漿，血清和尿液中提取高質(zhì)量的無(wú)細(xì)胞DNA，用于下一代測(cè)序（NGS），亞硫酸氫鹽測(cè)序，PCR，qPCR，ddPCR和其他苛刻的應(yīng)用
•用途廣泛： 從<1mL到> 10mL的血清或血漿中提取–在單管或24至96孔板中
•自動(dòng)化友好： 在KingFisher™和液體處理儀器上，提取過(guò)程大約需要50分鐘
•省時(shí)： 手動(dòng)提取協(xié)議耗時(shí)少于75分鐘
•具有成本效益： 從1毫升血漿中每次提取的*3美元（250毫升試劑盒的標(biāo)價(jià)）
•洗脫體積： 15 µL至50 µL
cfPure®方案快速簡(jiǎn)便，使用戶可以在一個(gè)小時(shí)或更短的時(shí)間內(nèi)處理多個(gè)樣品，非常適合生物標(biāo)志物篩選。BioChain開(kāi)發(fā)了自己的二氧化硅涂層磁珠技術(shù)，該技術(shù)旨在在分離過(guò)程中有效回收低分子量無(wú)細(xì)胞DNA。除了易于執(zhí)行和易于自動(dòng)化之外，如果要純化少量等離子體，還可以使用較少的磁珠溶液，從而節(jié)省了資金。成功分析cfDNA的關(guān)鍵是確保有效純化較小的DNA片段（100-500 bp）。如圖1所示，cfPure®無(wú)細(xì)胞DNA提取試劑盒可有效回收這些重要的小片段。
Cfpure設(shè)計(jì)為可擴(kuò)展的套件（圖2）。這意味著您可以僅使用cfDNA提取所需的珠子和試劑量。這也意味著每個(gè)試劑盒的提取次數(shù)取決于您要純化DNA的樣品量。例如，如果您使用的是1mL樣品，我們的100mL試劑盒（產(chǎn)品目錄號(hào)K5011610）多可以處理100個(gè)樣品，而我們的250mL試劑盒（產(chǎn)品目錄號(hào)K5011610）則可以處理250個(gè)樣品。如果您使用的是10mL樣品，那么我們的100mL試劑盒（目錄號(hào)K5011610）多可以處理10個(gè)樣品，而我們的250mL無(wú)細(xì)胞DNA提取試劑盒（目錄號(hào)K5011625）可以處理25個(gè)樣品。
與其他分離cfDNA的技術(shù)相比，磁珠具有許多優(yōu)勢(shì)。珠子比玻璃纖維過(guò)濾器更有效地結(jié)合DNA，從而獲得更高，更一致的產(chǎn)量。此外，由于不使用過(guò)濾器和真空歧管，因此在提取過(guò)程中不會(huì)存在細(xì)胞微粒堵塞這些物品的風(fēng)險(xiǎn)。對(duì)于cfDNA研究中常用的富含蛋白質(zhì)的大量樣品（例如血漿），此堵塞問(wèn)題尤為重要。
cfPure®cfDNA提取試劑盒提取的cfDNA非常適合下游應(yīng)用（例如NGS）。在第三方研究中，使用BioChain的cfPure®（B），競(jìng)爭(zhēng)者的T（T）和競(jìng)爭(zhēng)者的Q（基于列的Q）cfDNA提取試劑盒，從4個(gè)供體的10毫升人血漿中提取cfDNA。然后為每個(gè)樣品構(gòu)建文庫(kù)，并進(jìn)行全基因組測(cè)序。從數(shù)據(jù)分析來(lái)看，三種提取方法均未顯示出明顯的性能差異：插入片段大小（圖3），作圖速率，全基因組覆蓋率，取代率和GC偏差（圖4）。
我們優(yōu)化的基于磁珠的方案使用戶能夠擴(kuò)展方案，以用于從100 µl到10 ml的任何樣品體積，并具有高度可重復(fù)的結(jié)果和的cfDNA回收率（表1和2）。
cfPure®無(wú)細(xì)胞DNA提取試劑盒適用于KingFisher™（圖5）和液體處理儀器。借助KingFisher™Flex和BioChain的cfPure®無(wú)細(xì)胞DNA提取試劑盒，可在50分鐘內(nèi)提取多達(dá)96個(gè)1 ml樣品，或在一小時(shí)內(nèi)提取24個(gè)5 ml樣品。
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